Организация библиотеки Актюбинского государственного медицинского института началась в 1957 году с момента становлений всех подразделений института. Первыми сотрудниками были Нина Николаевна Девятова и Зоя Амиржановна Кинжегулова.
К началу первого учебного года книжный фонд библиотеки составлял лишь несколько десятков тысяч учебников, пособий, монографий, которые поступали из фондов библиотек ведущих медицинских учебных заведений Советского Союза: из 1 и 2 Московских, Харьковского, Пермского, 1- Ленинградского медицинских институтов, из библиотек Военно-морской Академии г. Москвы и научно-исследовательской лаборатории при Мавзолее им. В.И. Ленина и др. В период руководства библиотекой Епишкиной Лидией Ивановной (1961-1972 г.г.), приехавшей из Харьковского библиотечного института, работа заметно активизировалась. Она стремилась довести систему обслуживания в библиотеке до уровня Московской и Ленинградской библиотек. В это время и сформировался основной состав работников библиотеки: Трифонова В.И., Борадулина А.И., Яцук Г.П. и др. Велась, огромная работа по пополнению книжного фонда, созданы картотеки, предметный и систематический каталоги, реорганизован, алфавитный каталог. Книжный фонд комплектовался с учетом учебной и научной программ института, была четко налажена работа по использованию МБА (межбиблиотечный абонемент).
В период 1961-1972 г.г. фонд библиотеки составлял около 280 тысяч экз. книг. В эти годы коллектив библиотеки увеличился, в него пришли новые квалифицированные кадры: Ишеева Б.П., Танибергенова С.С., Гончарова Г.И., Потякина Е.И., Гагокина З.Ф., Мерзликина А.И., Кабышева Л.А., Брокоп А.П., Хабибуллина З.Г., Ионас М.М., Лазарева Л.Н., Саттарова К.Ш. и др.
С целью воспитания студентов в библиотеке проводились читательские конференции, литературные вечера, просмотры кинофильмов с последующим их обсуждением. К научным конференциям и знаменательным датам всегда были организованы книжные выставки.
В 1972 — 1994г.г. библиотекой руководила Зайнуллина Д.Г. В эти годы в библиотеку пришли Павленко Е.И., Изимова Н.И., Туткушева К.С., Турмагамбетова Г., Темирбаева С.С., Хайрикенова К.Д., Тюрежанова Г.А., Таильбекова Ш.Е., Тажимбетова Ш. Б., Аманжурова К.К и др.
С 2005 года по настоящее время руководитель библиотеки — Тюрежанова Г.А. Коллектив библиотеки пополнился молодыми специалистами библиотечного дела: Кряжова И.И., Бишенова У.Ж., Кирильчук О.А, Жайляуова Г.Т., Еналеева Р.Х., Сырбова Л.А. и др.
В настоящее время современная материально-техническая база библиотеки позволяет организовать специализированные читальные залы для работы с электронными ресурсами. К услугам преподавателей и студентов — 5 абонементов, 4 читальных зала, зал для работы с электронными ресурсами с доступом в Интернет.
Для самостоятельной работы преподавателей и студентов библиотека университета предоставляет возможность работы с отдаленными базами данных и электронными библиотеками: ЭБС «Консультант врача», «Консультант студента», EBSCO, «Кокрановской библиотеки», «Параграф» и др. Сегодня к услугам пользователей библиотеки более 20 полнотекстовых баз данных. Внедрена служба электронной доставки документа. Справочно-библиографический аппарат представляют предметный, систематический, алфавитный и электронный каталоги. Научная обработка документов ведется по универсальной десятичной классификации (УДК) и полного 4-го издания «Медицинские рубрики. Медицинские предметные рубрики. Русская версия Тезауреса». Созданный на основе автоматизированной библиотечно-информационной системы ИРБИС-64, электронный каталог включает библиографические базы данных «Книги», «Книгообеспеченность учебного процесса», «Статьи», «Документы на государственном языке», «Документы на иностранных языках», «Электронные книги». Ведется формирование полнотекстовой электронной библиотеки «Научные труды сотрудников». Деятельность библиотеки направлена на улучшение информационной поддержки новых направлений развития медицинского образования, науки и здравоохранения. Выполняя свои функции, библиотека сохраняет свои лучшие традиции. Дополняя их новыми формами работы, стремится к качественному росту.
В 2017 году открыт читальный зал и библиотека нового типа в помещении Конференц-холла им. Аккагаз Досжановой, с новым форматом библиотечного обслуживания студентов и ППС, действуют станции самообслуживания, открыт доступ к фонду и др. Внедрена услуга WEB кабинет преподавателя.
В читальном зале предусмотрены кабинеты для самостоятельной и групповой работы, а также индивидуального обучения иностранным языкам, имеется необходимая учебная и научная литература, самоучители и словари.
22-25 октября 2019года – впервые в Казахстане состоялся IV Библиофорум, XI международная научно-практическая конференция «Информационные технологии в медицинских библиотеках» на базе научно-медицинской библиотеке Западно-Казахстанского медицинского университета имени Марата Оспанова соорганизаторы: «Сибирский государственный медицинский университет» (г. Томск). Основная тема конференции «Определение роли и места медицинских библиотек в условиях «цифровизации»: новые вызовы. Направления работы конференции: Международное сотрудничество медицинских библиотек. Инструменты для управления научной деятельностью. Сервисы библиотеки: виртуальные и реальные. Аккредитация в вузах: «точки кипения»
Участниками форума стали сотрудники научных библиотек медицинских вузов России, Казахстана, Узбекистана, Чехии, Польши. Были представлены города: Москва, Томск, Курск, Прага, Владивосток, Варшава, Ташкент, Чимкент, Алматы, Воронеж, Усть-Каменогорск, Астана, Уральск.
Для решения основных задач библиотека университета сотрудничает с Ассоциацией библиотек вузов РК, Международной Ассоциацией пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий (ЭБНИТ) и с 2020г.- полноправный член Ассоциации медицинских библиотек СНГ.